Case StudiesFallstudien / NetPolyGen
Data Visualization · ResearchDatenvisualisierung · Forschung

NetPolyGen

An interactive visualization platform that turns complex gene-interaction network data — across thousands of human polygenic traits — into clear, explorable, publication-ready graphics for a genomics research group.Eine interaktive Visualisierungsplattform, die komplexe Daten zu Gen-Interaktionsnetzwerken — über Tausende menschlicher polygener Merkmale hinweg — in klare, erkundbare und publikationsreife Grafiken für eine genomische Forschungsgruppe verwandelt.

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The NetPolyGen web app: a protein-protein interaction network graph on the left beside a scatter plot of gene network complexity versus association significance on the right.
CLIENTKUNDE
Genomics research groupGenomische Forschungsgruppe
PRACTICELEISTUNG
Data VisualizationDatenvisualisierung
SCOPEUMFANG
Design & buildDesign & Umsetzung
OUTPUTERGEBNIS
Interactive web appInteraktive Web-App
netpolygen.comA screenshot of the NetPolyGen web app — its 'Network Connectivity – Avg pLi' view, a scatter plot of connected nodes versus edges with points coloured by average pLi.
A look at the live NetPolyGen app — the network-connectivity view, plotting connected nodes against edges with each point shaded by its average pLi.Ein Blick in die Live-App von NetPolyGen — die Ansicht der Netzwerk-Konnektivität, die verbundene Knoten gegen Kanten aufträgt, wobei jeder Punkt nach seinem durchschnittlichen pLi eingefärbt ist. See it live →Live ansehen →

Project overviewProjektüberblick

The research group studies how genes interact within the networks that shape complex, polygenic human traits — conditions driven by many genes at once, analysed at GWAS scale across thousands of traits. The results lived in static plots and raw files that were hard to interpret and harder to share. They needed a way to explore the data interactively and produce figures clean enough for publication — without a data engineer in the loop every time.Die Forschungsgruppe untersucht, wie Gene innerhalb der Netzwerke zusammenwirken, die komplexe, polygene menschliche Merkmale prägen — Eigenschaften, die von vielen Genen zugleich bestimmt und im GWAS-Maßstab über Tausende von Merkmalen hinweg analysiert werden. Die Ergebnisse steckten in statischen Plots und Rohdateien, die schwer zu interpretieren und noch schwerer zu teilen waren. Das Team brauchte eine Möglichkeit, die Daten interaktiv zu erkunden und Abbildungen zu erzeugen, die sauber genug für eine Publikation sind — ohne dass jedes Mal ein Data Engineer einbezogen werden muss.

THE CHALLENGEDIE HERAUSFORDERUNG

Complex, high-dimensional data with no consistent way to explore it. Static exports couldn't show structure or relationships, and every new figure meant manual work. The team needed something interactive, accurate, and reusable.Komplexe, hochdimensionale Daten ohne einheitliche Möglichkeit, sie zu erkunden. Statische Exporte konnten weder Strukturen noch Zusammenhänge zeigen, und jede neue Abbildung bedeutete Handarbeit. Das Team brauchte etwas Interaktives, Präzises und Wiederverwendbares.

THE SOLUTIONDIE LÖSUNG

We built a web platform that ingests their data and renders it as interactive, navigable visualizations — with filtering, detail-on-demand, and one-click export of publication-ready figures. Researchers explore freely; the figures stay consistent.Wir haben eine Web-Plattform entwickelt, die ihre Daten einliest und als interaktive, navigierbare Visualisierungen darstellt — mit Filterung, Detail-on-Demand und Ein-Klick-Export publikationsreifer Abbildungen. Forschende erkunden frei; die Abbildungen bleiben konsistent.

Key featuresWichtigste Funktionen

Interactive network viewsInteraktive Netzwerkansichten

Pan, zoom, and filter through large network structures in real time.Schwenken, zoomen und filtern Sie große Netzwerkstrukturen in Echtzeit.

Detail on demandDetails auf Abruf

Drill into any gene or interaction without losing the overall picture.Tauchen Sie in jedes Gen oder jede Interaktion ein, ohne den Gesamtüberblick zu verlieren.

Publication exportExport für Publikationen

Export clean, high-resolution figures ready to drop into a paper.Exportieren Sie saubere, hochauflösende Abbildungen, die direkt in eine Publikation passen.

Reusable pipelineWiederverwendbare Pipeline

New datasets flow in and render automatically — no rebuild required.Neue Datensätze fließen ein und werden automatisch dargestellt — kein Neuaufbau nötig.

Technologies usedEingesetzte Technologien

Data VisualizationDatenvisualisierungWeb AppWeb-AppInteractive GraphicsInteraktive GrafikenGWAS · STRING · MAGMANetwork AnalysisNetzwerkanalyse
RESULTS / IMPACTERGEBNISSE / WIRKUNG

From raw files to figures the team actually uses.Von Rohdateien zu Abbildungen, die das Team tatsächlich nutzt.

4,756
GWAS studies analysedanalysierte GWAS-Studien
3,302
human polygenic traitsmenschliche polygene Merkmale
OpenOffen
code on GitHub, data on ZenodoCode auf GitHub, Daten auf Zenodo
ReusableWiederverwendbar
new datasets render automaticallyneue Datensätze werden automatisch dargestellt

Have data that deserves to be understood?Haben Sie Daten, die es verdienen, verstanden zu werden?

We'd love to help you turn it into something clear and explorable.Wir helfen Ihnen gerne, daraus etwas Klares und Erkundbares zu machen.

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